Škoda Auto ha alcanzado los siete millones de coches fabricados desde su fusión con Volkswagen en 1991.
El 16 de abril de 1991 Škoda Auto fue adquirida por Volkswagen para integrarse dentro del Grupo. En esos momentos, Škoda Auto fabricaba el Favorit un modelo que se produjo del año 1988 hasta el 1994 cuando se presentó el Škoda Felicia. Desde ese año, Škoda Auto ha ido ampliando su gama de productos de forma constante.
Uno de los cambios más importantes de la historia de la marca llegó en 1996 con la presentación del Škoda Octavia. El Octavia fue el primer modelo desarrollado sobre una plataforma del Grupo Volkswagen y se presentó como una berlina de excelente relación calidad-precio. El éxito de este modelo ha sido tan grande que aún hoy en día se sigue produciendo y comercializando bajo la denominación Tour. En el año 2004 la gama Octavia se renovó completamente y, además de la versión familiar (Combi), la berlina y el RS (la versión deportiva), la marca comenzó a producir el Scout, un vehículo basado en Škoda Octavia Combi 4x4. Cuatro años más tarde, en octubre de 2008, Škoda Auto renovó la imagen del modelo.
Otro modelo innovador fue el Škoda Fabia, presentado en el 58º Salón Internacional del Automóvil de Frankfurt, en 1999. El vehículo llegó en tres versiones: hatchback, Sedan y Combi. En 2007, la segunda generación del Fabia sustituyó por completo a su antecesor. Actualmente, se encuentran disponibles dos versiones: el hatchback y el Combi.
En 2001, Škoda Auto ingresó en el segmento de las berlinas medio-altas con el Škoda Superb, un vehículo que retomaba la histórica tradición de la marca de producir coches de gama alta de principios del siglo pasado. En 2008, el buque insignia de la compañía fue modernizado y se convirtió en un vehículo completamente nuevo con un gran número de soluciones originales, entre ellas el nuevo sistema de apertura del maletero TwinDoor.
La aparición del Škoda Roomster en 2006, supuso el estreno de Škoda Auto en el segmento de los monovolúmenes pequeños.
La última novedad de Škoda Auto ha sido el nuevo Yeti. Presentado en el Salón Internacional del Automóvil de Ginebra de este mismo año, el Yeti se convirtió en el quinto modelo de la gama de productos y ha permitido la entrada de la marca checa en el segmento de los SUV.
Favorit 768.690 vehículos 1991 – 1995
Felicia 1.420.441 vehículos 1994 – 2001
Octavia Tour 1.389.546 vehículos 1996 – actualmente
Fabia 1.788.063 vehículos 1999 – 2008
Superb 136.068 vehículos 2001 – 2008
Octavia 900.535 vehículos 2004 – actualmente
Roomster 157.834 vehículos 2006 – actualmente
Fabia II 407.634 vehículos 2006 – actualmente
Superb II 31.189 vehículos 2008 – actualmente
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Total 7.000.000 vehículos